一步法RT-PCR从临床样本中检测到鼻病毒基因

    （武汉）为了建立一步法RT-PCR检测临床样本鼻病毒基因，并对扩增产物进行测序分析。研究者在鼻病毒基因组5′端非编码区选择一对鼻病毒特异性兼并引物建立一步法RT-PCR系统。对2004年春季收集的78份急性呼吸道感染患儿鼻咽拭子样本进行鼻病毒基因筛测，对扩增阳性的样本进行核苷酸测序并用生物信息学软件分析。结果78份鼻咽拭子样本用一步法RT-PCR检测出鼻病毒基因阳性11份，阳性率为14.1%，其中包括临床诊断为上呼吸道感染7例、支气管炎3例、肺炎1例。11份鼻病毒阳性样本用测序引物扩增并测序，测得的核苷酸序列经blast比对，与GeneBank中鼻病毒序列同源性分别高达89.0%～95.5%；11份样本序列之间的核苷酸同源性为75.2%～91.8%，核苷酸水平变异率为8.8%～31.0%；11份样本序列在进化树中聚类为两簇；11份样本序列高度保守区基因突变多为固定位点的单个核苷酸变异。可见所建立的一步法RT-PCR系统检测鼻病毒基因有快速、简便、特异性高的优点，适用于临床检测。临床样本测序分析发现，鼻病毒基因组有高度变异的特点。 /**/