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cDNA微阵列对22例弥漫型胃癌基因的检测 【 2006-10-16 发布 】 临床报道
(上海)为了从转录组水平识别弥漫型胃癌与正常胃黏膜间的基因表达差异,探讨胃癌分子发生发展机制。研究者收集22例弥漫型胃癌患者的新鲜冻存胃癌组织及同例相应正常胃黏膜。杂交芯片采用含14 592个点的cDNA表达谱芯片。差异表达基因的筛选标准为该基因在50%以上样本中的肿瘤与正常组织荧光强度比(ratio比值)>2或<0.5。采用系统聚类法进行基因表达的相似性分析,标本组间比较采用方差分析。应用实时定量RT-PCR方法对芯片结果进行验证。结果胃癌组织与正常胃黏膜间的差异表达基因共357个,其中表达上调者153个,下调者204个。上调基因功能主要与细胞骨架运动、基质重建、细胞增殖及信号传导等相关,下调基因功能则主要与细胞免疫防御、毒理代谢、功能分化、核-浆转运及凋亡抑制等相关。TNM分期的Ⅰ+Ⅱ期组与Ⅲ+Ⅳ期组间,有7个基因的表达差异有统计学意义(P<0.05)。RT-PCR验证结果与芯片表达结果一致。可见运用cDNA芯片进行弥漫型胃癌基因表达谱分析,有助于从分子水平全方位阐明弥漫型胃癌的发病机制及生物学特性,也有助于进一步发现新的分子诊断指标和基因治疗靶标。 /**/
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