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有助于检测癌症基因的算法 【 2006-07-17 发布 】 美迪医讯
研究人员开发了一种算法，能提高癌症基因的检测能力。该算法已被应用于描绘肺癌的肿瘤抑制基因。
研究人员用基因芯片发现，当从一组癌症病人的单份基因组或双份基因组删去染色体片断时，被删去的染色体片断能指出癌症所隐含的肿瘤抑制基因的位置。纽约大学Courant数学科学研究所(纽约, 纽约, 美国; www.cims.nyu.edu)的研究人员致力于自动化方法的研究，以可靠地检测这些基因及其位置和边界。他们开发的这种算法能采用Affymetrix(Santa Clara, CA, 美国)基因芯片的数据精确定位癌症中所含的基因，甚至在该基因组存在其它的无关缺失时也能做到。
为了验证他们的算法，研究人员制作了一种高保真的肿瘤硅胶模型，以考察当修改该模型的各种参数时，是否能很好地检测出正确的基因。他们将该算法应用于病人数据，并成功发现了文献中已知的许多基因，以及具有统计学意义的其它几种基因。该算法可用于检测癌症基因，这些基因在突变或过度表达时就能促进肿瘤生长。
该研究是由纽约大学Courant研究所和医学院(纽约, 纽约, 美国; www.med.nyu.edu)的Bud Mishra教授及其同事开展的。研究结果将在2006年7月的《美国人类遗传杂志》上进行报道。
纽约大学研究团队成员Salvatore Paxia博士和Thomas Anantharaman博士正在为该软件创建一个更简单的界面，使其兼容许多不同的芯片技术，从而走向大范围推广。
Courant Institute of Mathematical Sciences, NYU >> www.cims.nyu.edu
School of Medicine NYU >> www.med.nyu.edu
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有助于检测癌症基因的算法
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