人乳头瘤病毒cp6108的序列研究

    （南京）为了对尖锐湿疣中人乳头瘤病毒(HPV)cp6108进行序列研究。研究者应用TA克隆后测序和PCR产物直接测序进行HPV cp6108的基因序列测定。结果 5例HPV cp6108阳性的尖锐湿疣的模板DNA经TA克隆后测序和PCR产物直接测序结果显示，两种测序结果一致，BLAST比对结果显示，与基因库中HPV cp6108提交序列有99%的一致性，排在比对结果第1位，所有标本的cp6108的序列与网上提交序列对比后发现均有3处相同的密码子发生改变(以起始密码子GCA之G为第1位):第210位核苷酸G(鸟嘌呤，)突变为A(腺嘌呤)，导致第70位密码子GAG→GAA，发生同义突变；第229位核苷酸G(鸟嘌呤)突变为A(腺嘌呤)，导致第77位密码子GAT→AAT，编码的氨基酸由天冬氨酸(A8p，D)变为天冬酰氨(Asn，N)，即发生D77N错义突变；第346位核苷酸A(腺嘌呤)突变为C(胞嘧啶)，导致第116位ACT→CCT，编码的氨基酸由苏氨酸(Thr，T)变为脯氨酸(Pro，P)，即发生T116P错义突变。可见与基因库提交序列相比，本研究检测到的HPV cp6108序列中有3处突变，其中G70A为同义突变，D77N和T116P为错义突变。 /**/